MTEK3001 - Anvendt bioinformatikk og systembiologi

Faglig Innhold

Emnet gir innføring i bruk av sentrale metoder innenfor bioinformatikk, inkludert sekvenssøking, parvis og multippel alignment, fylogenetisk analyse, genprediksjon og strukturprediksjon. Bruken av metodene settes inn i en systembiologisk sammenheng, og ontologier, storskala-analyser og studier av komplekse systemer vil bli diskutert. Studentene får prøve ut metodene på realistiske problemstillinger gjennom PC-baserte øvinger. Det legges vekt på en tverrfaglig presentasjon og arbeidsform, slik at emnet skal kunne følges både av informatikere og medisinere / molekylærbiologer med de anbefalte forkunnskapene.

Læringsmål

Etter fullført og bestått emne skal studenten kunne: - forklare hovedprinsippene i viktige algoritmer og metoder brukt i bioinformatiske verktøy, inkludert dynamisk programmering, skjulte Markovmodeller og neurale nett - forklare funksjon og bruk av viktige bioinformatiske verktøy, særlig verktøy for analyser på sekvensnivå (genom, gen, RNA og protein) - beskrive viktige formater for lagring og utveksling av bioinformatiske data - beskrive innhold og bruk av viktige bioinformatiske databaser og web-portaler - beskrive bruken av bioinformatiske verktøy og databaser som basis for systembiologi - anvende bioinformatiske verktøy og databaser til å analysere relevante molekylærbiologiske data


http://www.ntnu.no/studier/emner/MTEK3001

Tags